Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mtmr1Q9Z2C4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mtmr1Q9Z2C4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms