Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn6Q9Z262 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms