Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cldn7Q9Z261 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn7Q9Z261 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms