Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn8Q9Z260 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn8Q9Z260 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms