Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Thbs4Q9Z1T2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms