Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ap3b1Q9Z1T1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3b1Q9Z1T1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms