Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1M4

Rps6kb2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb2Q9Z1M4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rps6kb2Q9Z1M4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms