Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5Q9Z131 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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Sh3bp5Q9Z131 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sh3bp5Q9Z131 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms