Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn13Q9Z0S4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms