Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gdf15Q9Z0J7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gdf15Q9Z0J7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms