Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn3Q9Z0G9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn3Q9Z0G9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms