Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms