Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV56

Gdf2, Growth/differentiation factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf2Q9WV56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gdf2Q9WV56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gdf2Q9WV56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms