Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam50aQ9WV03 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam50aQ9WV03 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms