Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Opn3Q9WUK7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Opn3Q9WUK7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms