Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pus1Q9WU56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pus1Q9WU56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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