Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTY1

Pdcd7, Programmed cell death protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd7Q9WTY1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdcd7Q9WTY1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdcd7Q9WTY1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms