Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PrkraQ9WTX2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms