Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdh13Q9WTR5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms