Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc2Q9R244 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms