Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TapbpQ9R233 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TapbpQ9R233 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TapbpQ9R233 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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