Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sorbs3Q9R1Z8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms