Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhx6Q9R1R0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx6Q9R1R0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx6Q9R1R0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhx6Q9R1R0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms