Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp6ap1Q9R1Q9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp6ap1Q9R1Q9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms