Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms