Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slit2Q9R1B9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slit2Q9R1B9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms