Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tpk1Q9R0M5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpk1Q9R0M5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpk1Q9R0M5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms