Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NrkQ9R0G8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NrkQ9R0G8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms