Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms