Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vav3Q9R0C8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms