Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpc6Q9R087 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gpc6Q9R087 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gpc6Q9R087 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gpc6Q9R087 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gpc6Q9R087 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Gpc6Q9R087 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gpc6Q9R087 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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