Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp11cQ9QZW0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms