Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf4Q9QZS2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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