Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Col4a3Q9QZS0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Col4a3Q9QZS0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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