Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copg1Q9QZE5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms