Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ChmlQ9QZD5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms