Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ercc4Q9QZD4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms