Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ubxn8Q9QZ49 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms