Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Six6Q9QZ28 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms