Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phtf1Q9QZ09 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms