Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VapbQ9QY76 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms