Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Irx4Q9QY61 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Irx4Q9QY61 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms