Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp1Q9QY53 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp1Q9QY53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms