Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnip3Q9QXT8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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