Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trp53inp1Q9QXE4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms