Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Limd1Q9QXD8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms