Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clca3a1Q9QX15 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms