Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV9

Ccnt1, Cyclin-T1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnt1Q9QWV9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnt1Q9QWV9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccnt1Q9QWV9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccnt1Q9QWV9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccnt1Q9QWV9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms