Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rai2Q9QVY8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms