Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PolkQ9QUG2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms